新疆大学有土木工程系,该系设置在新疆大学建筑工程学院下。 新疆大学建筑工程学院下设五个系:土木工程系、交通土建系、建筑与城市规划系、城市建设系、测绘工程系。其中“土木工程专业”被列为“自治区重点产业紧缺人才”专业,2009年“土木工程专业教学团队”被评为新疆大学校级和区级教学团队。在校级特色专业的基础上,2009年12月,土木工程专业被评为国家级特色专业。